Emne
Bioinformatikk (BIO510)
Dette er emnebeskrivelsen for studieåret 2013-2014. Merk at det kan komme endringer.
Semesters
Fakta
Emnekode
BIO510
Vekting (stp)
10
Semester undervisningsstart
Høst
Undervisningsspråk
Engelsk
Antall semestre
1
Vurderingssemester
Høst
Timeplan
Innhold
Ved hjelp av datamaskin orienterte øvinger formidler kurset grunnleggende og praktiske ferdigheter i bioinformatikk. Kurset omfatter følgende emner: grunnleggende forståelse og bruk av nettverksprotokoller som ftp, sftp, http og html. Bruk av gen-, protein/enzym- og strukturdatabaser (primære og sekundære databaser), primer konstrukasjon for PCR og RT-PCR (QPCR), lokal og global alignment, konstruksjon av fylogenetiske trær, og verktøy for sekvensanalyse.
Læringsutbytte
Studentene skal beherske grunnleggende ferdigheter i anvendt bioinformatikk blant annet grunnleggende forståelse og bruk av nettverksprotokoller som ftp, sftp, http og html, gen-, protein/enzym- og strukturdatabaser (primære og sekundære databaser), primer konstrukasjon for PCR og RT-PCR (QPCR), lokal og global alignment, konstruksjon av fylogenetiske trær, og verktøy for sekvensanalyse.
Forkunnskapskrav
Anbefalte forkunnskaper
Eksamen / vurdering
| Vurderingsform | Vekting | Varighet | Karakter | Hjelpemiddel | Exam system | Withdrawal deadline | Exam date |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Hjemmeoppgave | 1/1 | 2 Uker | Bokstavkarakterer | Inspera assessment | 01.11.2013 | — |
Vilkår for å gå opp til eksamen/vurdering
Obligatoriske innleveringer
Obligatorisk undervisningsaktivitet som må være gjennomført og godkjent før tilgang på laboratorium kan gis: Elektronisk HMS-kurs
Fagperson(er)
Ansvarlig laboratorieøvelser:
Liv Margareth AkslandInstituttleder:
Päivi Annele Teivainen-LædreEmneansvarlig:
Daniela Maria PampaninStudieprogramleder:
Mark van der GiezenFaglærer:
Klevia DishnicaArbeidsformer
2 timer forelesning og 2 timer datalab. Emnet krever grunnleggende kunnskaper i biokjemi. Obligatoriske arbeidskrav (som innlevering, laboratorieoppgaver, prosjektoppgaver og lignende) skal være godkjent av faglærer innen 3 uker før eksamensdato. Undervisningsspråk: engelsk.
Overlapping
| Emne | Reduksjon (SP) |
|---|---|
| Bioinformatikk (BIO510_1) , Bioinformatikk (MOT290_1) | 10 |
Åpent for
Master nivå på Det teknisk-naturvitenskapelige fakultetet
Emneevaluering
Skjer vanligvis gjennom skjema og/eller samtaler i henhold til gjeldende retningslinjer
Litteratur
Marketa Zvelebil and Jeremy Baum: Understanding Bioinformatics, New York, 2007. ISBN 9780815340249
Emnebeskrivelsen er hentet fra Felles studentsystem Versjon 1